自建房办房产证的费用收取需符合《不动产登记暂行条例》等法律法规的规定，以下结合具体条款分析适用情况。
根据《不动产登记暂行条例》第十六条，申请人需提交土地使用权证明、建设工程规划许可证等材料；第二十二条规定，登记机构应在受理后30个工作日内办结。费用方面，依据《国家发展改革委财政部关于不动产登记收费标准等有关问题的通知》（发改价格规〔2016〕2559号），住宅类不动产登记工本费为80元/本，非住宅类为550元/本；房屋测绘费由测绘机构按当地标准收取，属经营服务性收费。若自建房符合规划审批及验收要求，仅需缴纳上述工本费及测绘费；若存在手续缺失，需先按《城乡规划法》第六十四条补办手续并缴纳罚款，再办理登记缴费。
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自建房办房产证过程中可能存在以下法律风险，需提前防范。
1. 手续不全导致无法登记的风险：例如，某房主自建房时未办理建设工程规划许可证，完工后向登记机构申请房产证，因不符合《不动产登记暂行条例》第十六条的材料要求被驳回，无法取得房产证，导致房屋无法抵押、出售，影响财产权益。
2. 额外费用增加的风险：如某农村自建房房主未查询当地优惠政策，按非住宅标准缴纳了550元工本费，而实际上当地对农村宅基地自建房实行工本费减免政策，多缴的费用虽可申请退还，但增加了时间和沟通成本。
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自建房办房产证的费用需依据当地不动产登记机构的规定确定，不同情况费用构成存在差异。
自建房办房产证的费用需根据当地不动产登记机构的具体规定执行。

1. 若自建房已完成规划审批、竣工验收等全部法定手续：费用通常包括不动产登记工本费（一般为80元/本）、房屋测绘费（按建筑面积或当地标准收取），部分地区可能收取土地登记相关费用。
2. 若自建房存在规划或建设手续缺失：需先补办手续，可能产生罚款、补缴土地出让金等额外费用，具体金额由当地主管部门根据违规情况核定。
3. 若自建房属于农村宅基地上的合法建筑：部分地区对农民自建房实行费用减免政策，可能仅收取工本费。
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自建房办房产证的处理结果可能受以下特殊情况影响，需结合实际判断。
1. 历史遗留自建房的特殊政策：若自建房建于2008年《城乡规划法》实施前，且符合当时的建设规定但未办理手续，部分地区会出台历史遗留问题处理办法，允许按简化流程补办手续，费用可能降低，如免除罚款或减免测绘费，加快办理进度。
2. 当地优惠政策的适用：部分地区为鼓励农村自建房规范登记，对持有宅基地使用权证的农户实行工本费全免、测绘费减半政策，符合条件的房主可直接享受费用减免，减少办理成本。
3. 集体土地性质的特殊要求：若自建房位于集体土地上，且未转为国有建设用地，办理房产证时需提交集体土地使用权证及村委会出具的同意建设证明，费用标准可能与国有土地上自建房不同，部分地区集体土地自建房的测绘费按更低标准收取。

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